20 épisodes : "A la dérive", "Dernier Recours", "Retrouvailles", "Cauchemar sur Atlantis", "Les Voyageurs", "Perte de mémoire", "Seules contre tous", "Le Prophète", "Programmation mortelle", "Double collision", "Alliance forcée", "Conséquences", "Quarantaine", "Harmony", "Banni", "Trio", "Infiltration Wraith", "Hybrides : 1ère partie", "Hybrides : 2ème partie" et "Le Dernier Homme".